醫(yī)院是各種病人聚集的地方，也是各種病原微生物滋生的地方，所以，醫(yī)院環(huán)境的消毒也是一項(xiàng)非常重要的工作。
一般情況下，凡是沒有被傳染病病人接觸過的醫(yī)院環(huán)境，包括多數(shù)設(shè)備，只需徹底清洗，無需消毒。但當(dāng)遭受血液、體液污染或感染性疾病病人接觸過時，需用含有效氯0.5%～1%的消毒劑消毒；另外，營養(yǎng)室、配餐室的桌面、免疫力低下病人或易感病人的環(huán)境清潔消毒也可用含氯消毒劑。
用物理、化學(xué)以及生物的方法，使室內(nèi)空氣的含菌量盡量減少到無塵無菌狀態(tài)，常采用濕式清掃、定時通風(fēng)換氣和紫外線空氣消毒等措施。若遇傳染或嚴(yán)重感染性疾病病人出院可采用過氧乙酸噴霧或熏蒸進(jìn)行消毒。近年來，一些手術(shù)室、骨髓移植室以及無菌藥物制劑室等室內(nèi)的空氣，均采用生物凈化法使室內(nèi)空氣達(dá)到絕對凈化。
一般被服均經(jīng)洗滌后高溫消毒。對特殊感染所污染的被服最理想的滅菌方法是用環(huán)氧乙烷氣體素蒸滅菌。各科病人的被服可集中起來，先送環(huán)氧乙烷消毒間滅菌后，再送洗衣房清洗備用。
工作人員的手，一般情況下，用肥皂和流水清洗可去除表面一過性的污染菌。但如接觸過被致病菌污染的人或物后，不但要用肥皂和流水沖洗，還要用碘伏或其他滅菌液浸泡消毒。外科手術(shù)野和注射部位的皮膚宜先用2%~2.5%碘酊消毒一遍，20秒后再用75%酒精脫碘兩遍的消毒方法或選用碘伏消毒兩追的方法。粘膜的消毒可根據(jù)不同的部位選擇不同的消毒劑。
醫(yī)療器械以及其他物品是治療和檢查必不可少的用具，直接接觸病人的粘膜、創(chuàng)口等，所以是導(dǎo)致醫(yī)院感染的重要途徑，必須進(jìn)行嚴(yán)格的清潔、消毒、滅菌處理。消毒方法以壓力蒸汽滅菌法最為可靠。但對不耐高溫高壓的塑料、玻璃及銳利的手術(shù)刀、剪等可用化學(xué)消毒劑浸泡消毒滅菌。
凡穿透皮膚、粘膜進(jìn)入無菌組織的器材，均需嚴(yán)格滅菌，并首選壓力蒸汽滅菌；如外科手術(shù)器材、心導(dǎo)管、導(dǎo)尿管、針頭等，這類器材被任何致病微生物污染，都有引發(fā)嚴(yán)重感染的危險。凡接觸病人粘膜及有破損皮膚的器材，如呼吸機(jī)近端、麻醉機(jī)近端、內(nèi)窺鏡、口腔器械等，必須進(jìn)行滅菌和高水平的消毒處理，可選用熱消毒或性能良好的化學(xué)消毒劑，如環(huán)氧乙烷、2%戊二醛等。
由于完整的皮膚對多數(shù)微生物有屏障作用，所以對一些只與完整皮膚接觸的物品，如體溫計、便盆、血壓計袖帶、床頭柜等，不需滅菌處理，只需清洗干凈或選用低效消毒劑浸泡消毒即可。