微生物學(xué)檢驗實驗室軟件建設(shè)主要包括：工作人員的配置、工作管理制度的建設(shè)、微生物學(xué)檢驗項目的安排。
一、人員配置
工作人員配置是實驗室建設(shè)的重要組成部分，一般微生物學(xué)檢驗實驗室通常有檢驗工作人員和管理人員，有條件的實驗室還可配備專職清潔人員。
（1）檢驗工作人員
檢驗工作人員是從事食品的微生物檢驗和理化檢驗工作，并對食品原材料和食品包裝材料進行檢驗。微生物學(xué)項目實驗室通常配備3~5個人左右，且要求擁有相關(guān)學(xué)歷并取得職業(yè)資格職稱的從業(yè)者。另外，由于從事食品生產(chǎn)工作，還要求有健康證證明等有效證明資料。從業(yè)人員還應(yīng)該具有良好的衛(wèi)生習(xí)慣和職業(yè)道德，工作認真負責(zé)。
（2）管理人員
管理人員職責(zé)是負責(zé)管理整個實驗室的工作。主要從事監(jiān)督和安排其他人員的工作并處理其他重要事件，但也是最終責(zé)任人。因此，管理人員必須有經(jīng)驗有能力和能靈活處理各有關(guān)事務(wù)，負責(zé)管理整個組織系統(tǒng)的各方面工作。
二、工作管理制度的制定
每個企業(yè)都有自己的規(guī)章制度，對于食品生產(chǎn)工廠除要遵守國家的有關(guān)法律法規(guī)外，還要根據(jù)具體情況來制定嚴(yán)格的規(guī)章制度。微生物學(xué)檢驗實驗室的制度直接影響食品微生物學(xué)檢驗的結(jié)果，是關(guān)系到廣大消費者的身體健康問題，所以必須遵守國家的有關(guān)標(biāo)準(zhǔn)并結(jié)合工廠實際情況制定相關(guān)制度，做到各項規(guī)章制度健全、規(guī)范，使工廠工作達到程序化、規(guī)范化、科學(xué)化。
微生物學(xué)檢驗實驗室制度的建設(shè)主要包括實驗室管理制度和實驗室技術(shù)操作要求。
（1）實驗室制度建設(shè)
食品工廠微生物學(xué)檢驗實驗室制度主要包括：實.驗室管理制度；儀器配備和管理制度；藥品管理和使用制度；玻璃器皿管理和使用制度：安全制度；環(huán)境條件要求等。
（2）實驗室技術(shù)操作要求
食品工廠微生物學(xué)檢驗實驗室技術(shù)操作主要要求：無菌操作要求；無菌間使用要求；消毒滅菌要求；有毒有菌污染物處理要求；菌種保管要求；培養(yǎng)基制備要求；樣品采集及處理要求；樣品檢驗、記錄和報告要求等。
具體的工作管理制度在此不作詳細討論，企業(yè)可根據(jù)具體情況結(jié)合實際需要作適當(dāng)調(diào)整使用。
三、微生物學(xué)檢驗項目
微生物廣泛分布于自然界中，其中絕大多數(shù)的微生物是有益的，但對于食品而言由于微生物的污染，所造成糧食和食品的霉變、腐敗，以致引起食物中毒和傳染疾病等，此時對人類是有害的，直接關(guān)系到廣大人民的人身安全。食品的微生物檢驗項目主要有：菌落總數(shù)的測定、大腸菌群的測定和致病菌的測定等，
（1）菌落總數(shù)的測定
菌落總數(shù)指食品樣品經(jīng)過處理，在一定條件下培養(yǎng)后(如培養(yǎng)基成分、培養(yǎng)溫度和時間( PH值、需氧性質(zhì)等)，所得1m(g)樣品中所含菌落總數(shù)，是用來判定食品被細菌污染的程度及衛(wèi)生質(zhì)量，反映食品在生產(chǎn)過程中是否符合衛(wèi)生要求，以便對被檢樣品做出適當(dāng)?shù)男l(wèi)生學(xué)評價。
（2）大腸菌群的測定
大腸菌群指一群能發(fā)酵乳糖、產(chǎn)酸產(chǎn)氣、需氧和兼性厭氧的革蘭氏陰性無芽孢桿菌，主要包括：大腸埃希氏菌、檸檬酸桿菌、產(chǎn)氣克雷白化菌、陰溝腸桿菌等。該菌群主要來源于人畜糞便，故以此作為糞便污染指標(biāo)來評價食品的衛(wèi)生質(zhì)量推斷食品中大腸菌群及腸道致病菌污染，發(fā)現(xiàn)潛伏的食物中毒可能。
（3）致病菌的測定
致病菌的測定對實驗室及檢驗人員的條件要求較高，一般食品廠主要以送檢的形式來測定，由專門的有權(quán)威性機構(gòu)進行檢測。
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